cellmigRation

DOI:10.18129 / B9.bioc.cellmigRation

这是发展cellmigRation版本;稳定的发布版本,请参阅cellmigRation。

跟踪细胞,分析细胞轨迹和计算迁移数据

Bioconductor版本:发展(3.18)

进口荧光标记细胞的TIFF图像,随着时间的推移和追踪细胞运动。支持并行图像处理和快速计算细胞的轨迹。深入分析细胞的轨迹是通过15轨迹分析功能来实现的。

作者:萨利姆Ghannoum (aut (cph)达Fantini (aut (cph)也Leoncio (cre, aut)Øystein Sørensen (aut)

也维护人员:Leoncio < w.l.netto在medisin.uio.no >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“cellmigRation”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cellmigRation”)

HTML	R脚本	cellmigRation
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology,DataImport,DataRepresentation,软件
版本	1.9.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(2年)
许可证	GPL-2
取决于	R(> = 4.1),方法,foreach
进口	tiff、图形数据,跑龙套,reshape2平行,doParallel, grDevices, matrixStats, FME基金SpatialTools, sp, vioplot, FactoMineR Hmisc
链接
建议	RUnit knitr、rmarkdown dplyr, ggplot2,BiocGenerics,kableExtra BiocManager rgl
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ocbe-uio/cellmigRation/
BugReports	https://github.com/ocbe-uio/cellmigRation/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cellmigRation_1.9.0.tar.gz
Windows二进制	cellmigRation_1.9.0.zip
macOS二进制(x86_64)	cellmigRation_1.9.0.tgz
macOS二进制(arm64)	cellmigRation_1.9.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellmigRation
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cellmigRation
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/cellmigRation/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cellmigRation/
包下载报告	下载数据