celaref

DOI:10.18129 / B9.bioc.celaref

这是发展celaref版本;稳定的发布版本,请参阅celaref。

单细胞RNAseq细胞集群通过引用标签

Bioconductor版本:发展(3.18)

单细胞RNAseq实验的聚类步骤之后,这个计划的目的是建议标签/细胞类型的集群,相似性的基础上,参考数据集。它需要读表数每细胞基因,和一系列的细胞属于每个集群,(用于测试和参考数据)。

作者:莎拉·威廉姆斯(aut (cre)

维护人员:莎拉·威廉姆斯<萨拉。在monash.edu williams1 >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“celaref”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“celaref”)

HTML	R脚本	手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	SingleCell,软件
版本	1.19.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5.0),SummarizedExperiment
进口	桅杆,矩阵ggplot2 dplyr magrittr,统计,跑龙套,rlang,BiocGenerics,S4Vectorsreadr宠物猫,DelayedArray
链接
建议	limma、平行、knitr rmarkdown,ExperimentHub,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	celaref_1.19.0.tar.gz
Windows二进制	celaref_1.19.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	celaref_1.19.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/celaref
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ celaref
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/celaref/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/celaref/
包下载报告	下载数据