celaref

DOI:10.18129 / B9.bioc.celaref

这是发展celaref版本;稳定的发布版本,请参阅celaref

单细胞RNAseq细胞集群通过引用标签

Bioconductor版本:发展(3.18)

单细胞RNAseq实验的聚类步骤之后,这个计划的目的是建议标签/细胞类型的集群,相似性的基础上,参考数据集。它需要读表数每细胞基因,和一系列的细胞属于每个集群,(用于测试和参考数据)。

作者:莎拉·威廉姆斯(aut (cre)

维护人员:莎拉·威廉姆斯<萨拉。在monash.edu williams1 >

从内部引用(R,回车引用(“celaref”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“celaref”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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细节

biocViews SingleCell,软件
版本 1.19.0
Bioconductor自 BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.5.0),SummarizedExperiment
进口 桅杆,矩阵ggplot2 dplyr magrittr,统计,跑龙套,rlang,BiocGenerics,S4Vectorsreadr宠物猫,DelayedArray
链接
建议 limma、平行、knitr rmarkdown,ExperimentHub,testthat
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 celaref_1.19.0.tar.gz
Windows二进制 celaref_1.19.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) celaref_1.19.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/celaref
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ celaref
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/celaref/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/celaref/
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