cbpManager

DOI:10.18129 / B9.bioc.cbpManager

这是发展cbpManager版本;稳定的发布版本,请参阅cbpManager。

生成、管理和编辑数据和元数据文件适用于进口cBioPortal癌症基因组学

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个R包提供了一个闪亮的应用程序,允许用户生成、管理和编辑数据和元数据文件适用于进口cBioPortal癌症基因组学。创建癌症研究和编辑它的元数据。上传数据突变的病人将data_mutation_extended连接。这项研究的txt文件。创建和编辑临床病人数据,样本数据和时间数据。创建自定义时间追踪病人。

作者:Arsenij Ustjanzew (cre, aut cph],费德里科•马里尼(aut)

维护人员:Arsenij Ustjanzew < Arsenij。在gmail.com ustjanzew >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“cbpManager”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cbpManager”)

HTML	R脚本	intro.html
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport,DataRepresentation,GUI,ImmunoOncology,预处理,软件,ThirdPartyClient,可视化
版本	1.7.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	AGPL-3 +文件许可证
取决于	闪亮的,shinydashboard
进口	跑龙套,DT,htmltools,发呜呜声,plyr,dplyr,magrittr,jsonlite,rapportools,蛇怪,网状,shinyBS,shinycssloaders,rintrojs,减价
链接
建议	knitr,BiocStyle,rmarkdown,testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://arsenij-ust.github.io/cbpManager/index.html
BugReports	https://github.com/arsenij-ust/cbpManager/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cbpManager_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	cbpManager_1.7.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	cbpManager_1.7.0.tgz
macOS二进制(arm64)	cbpManager_1.7.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cbpManager
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cbpManager
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/cbpManager/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cbpManager/
包下载报告	下载数据