cancerclass

DOI:10.18129 / B9.bioc.cancerclass

这是发展cancerclass版本;稳定的发布版本请参见cancerclass

基于高维分子数据的诊断测试开发和验证

生物导体版本:开发(3.13)

分类协议从特征选择步骤开始,然后继续进行最近质心分类。预测器的准确性可以通过训练和测试集验证、留一交叉验证或多个随机验证方案来评估。连续预测评分的计算和可视化方法可以平衡敏感性和特异性,并根据临床需求确定临界值。

作者:Jan budcies, Daniel Kosztyla

维护者:Daniel Kosztyla

引文(从R中输入引用(“cancerclass”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!#初始化BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("cancerclass")

有关较旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“cancerclass”)

PDF R脚本 癌症类:用于开发和验证高维分子数据诊断测试的R包
PDF 参考手册

细节

biocViews 癌症,分类,微阵列,软件,可视化
版本 1.35.0
Bioconductor自 BioC 2.11 (R-2.15)(8.5年)
许可证 GPL 3
取决于 R (> = 2.14.0),Biobase,binom、方法、统计数据
进口
链接
建议 cancerdata
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 cancerclass_1.35.0.tar.gz
Windows二进制 cancerclass_1.35.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) cancerclass_1.35.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cancerclass
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cancerclass
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/cancerclass/
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  • 正常词 邮件列表-为包开发人员bob电竞体育官网