- 家
- Bioconductor 3.18
- 软件包
- 北欧化工(开发版)
北欧化工
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DOI:10.18129 / B9.bioc.borealis
这是发展北欧化工的版本;稳定的发布版本,请参阅北欧化工。
在单分辨率Bisulfite-seq异常甲基化
Bioconductor版本:发展(3.18)
北欧化工是一个基于R库执行异常值分析点重亚硫酸盐测序数据。它从酸性亚硫酸盐测序检测异常甲基化CpG网站(BS-seq)。北欧化工的核心是建模Beta-Binomial分布。这对罕见疾病的诊断可能是有用的。
作者:Garrett詹金森(aut (cre)
维修工:Garrett詹金森< gargar934 gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“北欧化工”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“北欧化工”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 报道,DNAMethylation,DifferentialMethylation,测序,软件 |
| 版本 | 1.5.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.15 (r - 4.2)(1年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 4.2.0),Biobase |
| 进口 | doParallel、雪、purrr plyr、foreach gamlss, gamlss.dist,bsseq、方法、DSS,R。跑龙套,跑龙套,统计,ggplot2、cowplot dplyr, rlang,GenomicRanges |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,rmarkdown knitr RUnit,BiocGenerics,annotatrtidyr,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,org.Hs.eg.db |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | |
| Windows二进制 | borealis_1.5.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | borealis_1.5.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/borealis |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/好 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/borealis/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/borealis/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
