bnem

DOI:10.18129 / B9.bioc.bnem

这是发展bnem版本;稳定的发布版本,请参阅bnem。

训练逻辑模型的间接测量扰动的实验

Bioconductor版本:发展(3.17)

bnem结合使用嵌套的间接测量效应模型(包mnem) CellNOptR的布尔网络。扰动实验细胞的信号节点分析的全球基因表达谱的影响。这些概要文件提供证据的布尔加调节节点网络,例如,是否两个父母激活孩子独立(或门)或联合(与门)。

作者:马丁Pirkl (aut (cre)

维护人员:马丁Pirkl < martinpirkl在yahoo.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“bnem”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“bnem”)

HTML	R脚本	bnem.html
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,GeneRegulation,网络,NetworkInference,通路,预处理,软件,SystemsBiology
版本	1.7.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.1)
进口	CellNOptR,matrixStats,降雪,Rgraphviz,集群,flexclust统计数据,RColorBrewer,epiNEM,mnem,Biobase、方法、跑龙套、图形图,affy,binom,limma,股东价值分析,vsn,rmarkdown
链接
建议	knitr,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/MartinFXP/bnem/
BugReports	https://github.com/MartinFXP/bnem/issues
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	bnem_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	bnem_1.7.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	bnem_1.7.0.tgz
macOS二进制(arm64)	bnem_1.7.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bnem
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bnem
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/bnem/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bnem/
包下载报告	下载数据