bnbc

DOI:10.18129 / B9.bioc.bnbc

这是发展bnbc版本;稳定的发布版本,请参阅bnbc。

Bandwise正常化和批处理高c数据的修正

Bioconductor版本:发展(3.16)

规范化的工具(几个)高c的数据复制。

作者:腌Fletez-Brant (cre, aut], Kasper丹尼尔·汉森(aut)

维护人员:腌Fletez-Brant < cafletezbrant gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“bnbc”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“bnbc”)

HTML	R脚本	bnbc用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	嗝,归一化,预处理,软件
版本	1.19.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 3.5.0)、方法BiocGenerics,SummarizedExperiment,GenomicRanges
进口	Rcpp(> = 0.12.12),IRanges,rhdf5,data.table,GenomeInfoDb,S4Vectors,matrixStats,preprocessCore,股东价值分析平行,EBImage,跑龙套
链接	Rcpp
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/hansenlab/bnbc
BugReports	https://github.com/hansenlab/bnbc/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	bnbc_1.19.0.tar.gz
Windows二进制	bnbc_1.19.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	bnbc_1.19.0.tgz
macOS二进制(arm64)	bnbc_1.19.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bnbc
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bnbc
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bnbc/
包下载报告	下载数据