咆哮

DOI:10.18129 / B9.bioc.bluster

这是发展版本的恫吓;稳定版请参见咆哮．

生物导体的聚类算法

Bioconductor版本:开发(3.17)

将常见的聚类算法封装在易于扩展的S4框架中。后端实现了分层、k-means和基于图的聚类。还提供了几个实用程序来比较和评估聚类结果。

作者:Aaron Lun [aut, cre]， Stephanie Hicks [ctb]

维护者:Aaron Lun 的键盘

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("bluster")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“咆哮”)

超文本标记语言	R脚本	1.聚类算法
超文本标记语言	R脚本	2.聚类诊断
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，GeneExpression，ImmunoOncology，SingleCell，软件，转录组
版本	1.9.1
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	统计，方法，效用，集群，矩阵，Rcpp，igraph，S4Vectors，BiocParallel，BiocNeighbors
链接	Rcpp
建议	knitr，rmarkdown，testthat，BiocStyle，dynamicTreeCut，scRNAseq，天窗，嘘，食物，pheatmap，冬青，mbkmeans，kohonen，apcluster
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
全靠我	OSCA。先进,OSCA。basic, OSCA.intro, OSCA。multisample OSCA。工作流,SingleRBook
进口我	scDblFinder，食物，“航行者”号
建议我	后面;，ChromSCape，dittoSeq，mbkmeans，mumosa
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	bluster_1.9.1.tar.gz
Windows二进制	bluster_1.9.1.zip
macOS二进制文件(x86_64)	bluster_1.9.1.tgz
macOS二进制文件(arm64)	bluster_1.9.1.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bluster
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bluster
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/bluster/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bluster/
软件包下载报告	下载数据