blacksheepr

DOI:10.18129 / B9.bioc.blacksheepr

这是发展黑羊的版本;稳定版请参见blacksheepr

两两差异比较的离群值分析

Bioconductor版本:开发(3.16)

Blacksheep是一种用于两两比较背景下的离群值分析的工具,旨在发现两个组之间的区别特征。该工具被设计用于生物应用,如磷蛋白组学或转录组学,但它可以用于任何可以用2D表表示的数据,并且在表中有两个亚种群进行比较。

作者:MacIntosh Cornwell [aut], RugglesLab [cre]

维护:RugglesLab < RugglesLab at gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“blacksheepr”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("blacksheepr")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“blacksheepr”)

超文本标记语言 R脚本 用黑羊磷蛋白进行离群分析
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpressionRNASeq测序软件转录转录组
版本 1.11.0
在Bioconductor BioC 3.10 (R-3.6)(2.5年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 3.6)
进口 grid, stats, grDevices, utils,circlize冬青RColorBrewerComplexHeatmapSummarizedExperimentpasilla
链接
建议 testthat(> =魅惑,knitrBiocStylermarkdown旋度
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/ruggleslab/blacksheepr/issues
全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 blacksheepr_1.11.0.tar.gz
Windows二进制 blacksheepr_1.11.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) blacksheepr_1.11.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/blacksheepr
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/blacksheepr
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/blacksheepr/
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