biomvRCNS

DOI:10.18129 / B9.bioc.biomvRCNS

这是发展生物vrcns版本;稳定版请参见biomvRCNS．

多元生物数据拷贝数研究与分割

Bioconductor版本:开发(3.16)

在这个包中，设计和实现了一个隐藏的半马尔可夫模型(HSMM)和一个同质分割模型，用于分割基因组数据，目的是帮助使用RNA-seq或tiling阵列等高通量技术进行转录本检测，并使用aCGH或测序进行拷贝数分析。

作者:杨度

维护人员:杨度

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("biomvRCNS")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“biomvRCNS”)

PDF	R脚本	biomvRCNS包介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation，遗传学，微阵列，测序，软件，可视化，aCGH
版本	1.37.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(9.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.5.0)，IRanges，GenomicRanges，Gviz
进口	方法,mvtnorm
链接
建议	集群平行,GenomicFeatures，dynamicTreeCut，Rsamtools，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	biomvRCNS_1.37.0.tar.gz
Windows二进制	biomvRCNS_1.37.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	biomvRCNS_1.37.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biomvRCNS
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/biomvRCNS
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/biomvRCNS/
软件包下载报告	下载数据