biodbNcbi

DOI:10.18129 / B9.bioc.biodbNcbi

这是发展biodbNcbi版本;稳定的发布版本,请参阅biodbNcbi。

为连接到NCBI数据库biodbNcbi、图书馆。

Bioconductor版本:发展(3.18)

biodbNcbi库提供了访问NCBI数据库ccd,基因,Pubchem Comp和Pubchem路径替换,使用biodb包框架。它允许加入检索条目的数量。Web服务可以搜索访问数据库的名字或质量。

作者:Pierrick罗杰(aut (cre)

维护人员:Pierrick罗杰< Pierrick。罗杰在cea.fr >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“biodbNcbi”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“biodbNcbi”)

HTML	R脚本	介绍biodbNcbi包。
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,基础设施,软件
版本	1.5.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(1年)
许可证	AGPL-3
取决于	R (> = 4.1)
进口	biodb(> = 1.3.2)、R6 XML,嗯
链接
建议	roxygen2,BiocStyletestthat (> = 2.0.0)、devtools knitr, rmarkdown, covr lgr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/pkrog/biodbNcbi
BugReports	https://github.com/pkrog/biodbNCbi/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	biodbNcbi_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	biodbNcbi_1.5.0.zip
macOS二进制(x86_64)	biodbNcbi_1.5.0.tgz
macOS二进制(arm64)	biodbNcbi_1.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biodbNcbi
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ biodbNcbi
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/biodbNcbi/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/biodbNcbi/
包下载报告	下载数据