biodbMirbase

DOI:10.18129 / B9.bioc.biodbMirbase

这是发展biodbMirbase版本;稳定版请参见biodbMirbase。

biodbMirbase连接miRBase成熟数据库的库

Bioconductor版本:开发(3.17)

biodbMirbase库是biodb框架包的扩展，提供了对miRBase成熟数据库的访问。它允许根据条目的登录号检索条目，并运行特定的web服务。描述:biodbMirbase库提供了对miRBase数据库的访问，使用biodb包框架。

作者:Pierrick Roger [aut, cre]

维护者:Pierrick Roger < Pierrick。收到，在cea.fr>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("biodbMirbase")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“biodbMirbase”)

超文本标记语言	R脚本	biodbMirbase包介绍。
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，基础设施，软件
版本	1.3.0
在Bioconductor	BioC 3.15 (R-4.2)(1年)
许可证	AGPL-3
取决于	R (>= 4.1)
进口	biodb(> = 1.3.1),R6，stringr，嗯
链接
建议	roxygen2，BiocStyle，testthat(> = 2.0.0),devtools，knitr，rmarkdown，covr，lgr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	biodbMirbase_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	biodbMirbase_1.3.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	biodbMirbase_1.3.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	biodbMirbase_1.3.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biodbMirbase
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/biodbMirbase
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/biodbMirbase/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/biodbMirbase/
软件包下载报告	下载数据