biocViews

DOI:10.18129 / B9.bioc.biocViews

这是发展biocViews版本;稳定的发布版本,请参阅biocViews。

分类视图的R包存储库

Bioconductor版本:发展(3.16)

基础设施,以支持“视图”用于分类Bioconductor包。“biocViews”是有向无环图从受控词汇表术语。有三个主要的分类,对应于“软件”,“注释”,和实验数据的包。

作者:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >, BJ Harshfield < rebjh channing.harvard.edu >,猎鹰< sfalcon fhcrc.org >, Sonali Arora, Lori牧羊人<罗莉。牧羊人在roswellpark.org >

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“biocViews”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“biocViews”)

PDF	R脚本	biocViews-CreateRepositoryHTML
PDF	R脚本	biocViews-HOWTO
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施,软件
版本	1.65.1
Bioconductor自	BioC 1.8 (r - 2.3)(16.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	Biobase,图(> = 1.9.26)、方法RBGL(> = 1.13.5)、工具、跑龙套,XML,RCurl,RUnit,BiocManager
链接
建议	BiocGenerics,knitr,commonmark
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocViews
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocViews/issues
取决于我	Risa
进口我	AnnotationHubData,BiocCheck,BiocPkgTools,单片眼镜,RforProteomics,sigFeature
建议我	packFinder
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	biocViews_1.65.1.tar.gz
Windows二进制	biocViews_1.65.1.zip
macOS 10.13(高山脉)	biocViews_1.65.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biocViews
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ biocViews
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/biocViews/
包下载报告	下载数据