- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- biocGraph(开发版)
biocGraph
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DOI:10.18129 / B9.bioc.biocGraph
这是发展biocGraph版本;稳定的发布版本,请参阅biocGraph。
在生物信息学和用例图示例
Bioconductor版本:发展(3.17)
这个包提供了例子和代码,利用不同的图包由Bioconductor有关。
作者:李长<李。在isb-sib长。ch >,罗伯特先生< rgentlem fhcrc.org >,赛斯猎鹰Florian Hahne < sethf fhcrc.org > < fhahne fhcrc.org >
维护人员:Florian Hahne <弗洛里安。在novartis.com hahne >
从内部引用(R,回车引用(“biocGraph”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“biocGraph”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“biocGraph”)
| R脚本 | 使用Rgraphviz绘制图表的例子 | |
| R脚本 | HOWTO布局通路 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | GraphAndNetwork,软件,可视化 |
| 版本 | 1.61.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.1 (r - 2.6)(15.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | Rgraphviz,图 |
| 进口 | Rgraphviz,geneplotter,图,BiocGenerics、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | fibroEset,geneplotter,hgu95av2.db |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | EnrichmentBrowser |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | biocGraph_1.61.0.tar.gz |
| Windows二进制 | biocGraph_1.61.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | biocGraph_1.61.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | biocGraph_1.61.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biocGraph |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ biocGraph |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/biocGraph/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/biocGraph/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
