这是发展生物室的版本;对于稳定版本,请参阅生物室。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包包含用于转换由生物信息学软件包构建的标准对象的方法,尤其是在生物导体中的对象,并将其转换为整洁数据。因此,它是对扫帚套件的补充,并遵循相同的整理,增强,一眼整理方法的划分。整理数据使重组,重塑和可视化生物信息学分析变得容易。
作者:安德鲁·J·巴斯(Andrew J. Bass),戴维·G·罗宾逊(David G.
维护者:John D. Storey
引用(从r内,输入引用(“生物室”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ Biobroom”(“ Biobroom”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“生物室”)
html | R脚本 | 小插图标题 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DataImport,,,,差异性,,,,基因表达,,,,多重组合,,,,蛋白质组学,,,,回归,,,,软件 |
版本 | 1.29.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.2(R-3.2)(6。5年) |
执照 | LGPL |
要看 | r(> = 3.0.0),扫帚 |
进口 | dplyr,,,,花花公子,,,,生物酶 |
链接 | |
建议 | 林玛,,,,deseq2,,,,呼吸道,,,,GGPLOT2,,,,plyr,,,,基因组机,,,,测试,,,,马格里特,,,,EDGER,,,,QVALUE,,,,尼特,,,,Data.Table,,,,MSNBase,,,,rmarkDown,,,,总结性特征 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/storeylab/biobroom |
BugReports | https://github.com/storeylab/biobroom/issues |
取决于我 | |
进口我 | TPP |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Biobroom_1.29.0.tar.gz |
Windows二进制 | Biobroom_1.29.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | Biobroom_1.29.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biobroom |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/生物室 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/biobroom/ |
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