生物室

doi:10.18129/b9.bioc.biobroom

这是发展生物室的版本;对于稳定版本,请参阅生物室

将生物导体对象变成整洁的数据框架

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包包含用于转换由生物信息学软件包构建的标准对象的方法,尤其是在生物导体中的对象,并将其转换为整洁数据。因此,它是对扫帚套件的补充,并遵循相同的整理,增强,一眼整理方法的划分。整理数据使重组,重塑和可视化生物信息学分析变得容易。

作者:安德鲁·J·巴斯(Andrew J. Bass),戴维·G·罗宾逊(David G.

维护者:John D. Storey 和Andrew J. Bass

引用(从r内,输入引用(“生物室”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ Biobroom”(“ Biobroom”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“生物室”)

html R脚本 小插图标题
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,差异性,,,,基因表达,,,,多重组合,,,,蛋白质组学,,,,回归,,,,软件
版本 1.29.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(6。5年)
执照 LGPL
要看 r(> = 3.0.0),扫帚
进口 dplyr,,,,花花公子,,,,生物酶
链接
建议 林玛,,,,deseq2,,,,呼吸道,,,,GGPLOT2,,,,plyr,,,,基因组机,,,,测试,,,,马格里特,,,,EDGER,,,,QVALUE,,,,尼特,,,,Data.Table,,,,MSNBase,,,,rmarkDown,,,,总结性特征
系统要求
增强
URL https://github.com/storeylab/biobroom
BugReports https://github.com/storeylab/biobroom/issues
取决于我
进口我 TPP
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Biobroom_1.29.0.tar.gz
Windows二进制 Biobroom_1.29.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) Biobroom_1.29.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biobroom
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/生物室
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/biobroom/
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