bioassayR

DOI:10.18129 / B9.bioc.bioassayR

这是发展bioassayR版本;稳定的发布版本,请参阅bioassayR。

Cross-target小分子生物活性的分析

Bioconductor版本:发展(3.18)

bioassayR是一种计算工具,使成千上万的生物测定实验进行的同时分析了一组不同的化合物和生物的目标。独特的功能,包括支持大规模cross-target分析公共和定制的生物,一代的高通量筛选指纹(HTSFPs),和一个可选的预加载数据库提供公开的生物活性数据的很大一部分。

作者:泰勒后方,罗恩Schlenk,托马斯Girke

维护人员:Daniela Cassol < danicassol gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“bioassayR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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HTML	R脚本	bioassayR介绍和例子
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文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学,CellBasedAssays,DataImport,ImmunoOncology,基础设施,代谢组学,MicrotitrePlateAssay,蛋白质组学,软件,可视化
版本	1.39.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(9.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0), DBI (> = 0.3.1) RSQLite(> = 1.0.0)方法,矩阵,rjson,BiocGenerics(> = 0.13.8)
进口	XML,ChemmineR
链接
建议	BiocStyleRCurl,biomaRt,cellHTS2,knitcitations knitr knitrBootstrap、testthat ggplot2 rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/girke-lab/bioassayR
BugReports	https://github.com/girke-lab/bioassayR/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	bioassayR_1.39.0.tar.gz
Windows二进制	bioassayR_1.39.0.zip
macOS二进制(x86_64)	bioassayR_1.39.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioassayR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bioassayR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/bioassayR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bioassayR/
包下载报告	下载数据