生物扫描

DOI：10.18129 / b9.bioc.biocancer.

这是发展生物扫描版;对于稳定的版本版本，请参阅生物扫描。

交互式多OMICS癌症数据可视化和分析

Bioconductor版本：开发（3.13）

Biocancer是一个闪亮的应用程序，可视化和分析癌症基因组数据的交互式多测定。

作者：Karim Mezhoud [Aut，CRE]

维护者：Karim Mezhoud

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！carcenamespace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）＃以下初始化Buoc Devel Biocmanager :: Install（版本='devel'）BiocManager ::安装（“Biocancer”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“Biocancer”）

HTML.	r script.	生物扫描：交互式多OMICS癌症数据可视化和分析
PDF.		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

Biocviews.	datarepresentation那吉伊那基因表达那geetarget.那多匹匹莫森那网络那途径那反应那软件那可视化
版本	1.19.01
在生物导体中以来	BIOC 3.4（R-3.3）（4.5岁）
执照	AGPL-3 |文件执照
依靠	r（> = 3.6.0），Radiant.data.（> = 0.9.1），CGDSR.（> = 1.2.6），XML.（> = 3.98）
进口	DT.（> = 0.3），dplyr.（> = 0.7.2），闪亮的（> = 1.0.5），algdesign.（> = 1.1.7.3），进口（> = 1.1.0），方法，ShinyThemes.那BioBase.那Genetclassifier那annotationfuncs.那org.hs.eg.db.那剂量那ClusterProfiler.那反弹.DB.那反弹那译文（<= 1.01），visnetwork.那HTMLWidgets.那普利尔那娇媚
链接到
建议	生物焦那RAMAMAMDOW.那kn那testthat.（> = 0.10.0）
系统要求
加强
URL.	http://kmezhoud.github.io/biocancer.
Bugreports.	https://github.com/kmezhoud/biocancer/issues.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	biocancer_1.19.01.tar.gz.
Windows二进制文件	biocancer_1.19.01.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	biocancer_19.01.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/biocancer.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/生物扫描
包短网址	https://biocumon.org/packages/biocancer/
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