bigPint

DOI:10.18129 / B9.bioc.bigPint

这是发展bigPint版本;稳定的发布版本,请参阅bigPint。

大的多元数据绘制交互

Bioconductor版本:发展(3.17)

大型多元数据集使用静态可视化方法和交互式散点图矩阵,平行坐标图,火山地块,升的情节。包括例子RNA-sequencing可视化数据集和差异表达基因。

作者:林赛·拉特(aut (cre) Dianne库克(aut)

维护人员:林赛·拉特< lindsayannerutter gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“bigPint”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“bigPint”)

HTML	R脚本	bigPint装饰图案
HTML	R脚本	数据度量对象
HTML	R脚本	推荐RNA-seq管道
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类,DataImport,DifferentialExpression,GeneExpression,MultipleComparison,归一化,预处理,质量控制,RNASeq,测序,软件,转录,可视化
版本	1.15.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	DelayedArray(> = 0.12.2),dplyr(> = 0.7.2),GGally(> = 1.3.2),ggplot2(> = 2.2.1),图形(> = 3.5.0),grDevices(> = 3.5.0),网格(> = 3.5.0),gridExtra(> = 2.3),hexbin(> = 1.27.1),Hmisc(> = 4.0.3),htmlwidgets(> = 0.9)、方法(> = 3.5.2),情节(> = 4.7.1),plyr(> = 1.8.4),RColorBrewer(> = 1.1.2),重塑(> = 0.8.7),闪亮的(> = 1.0.5),shinycssloaders(> = 0.2.0),shinydashboard(> = 0.6.1),数据(> = 3.5.0),stringr(> = 1.3.1),SummarizedExperiment(> = 1.16.1),tidyr(> = 0.7.0),跑龙套(> = 3.5.0)
链接
建议	BiocGenerics(> = 0.29.1),data.table(> = 1.11.8),EDASeq(> = 2.14.0),刨边机(> = 3.22.2),gtools(> = 3.5.0),knitr(> = 1.13),matrixStats(> = 0.53.1),rmarkdown(> = 1.10),roxygen2(> = 3.0.0),RUnit(> = 0.4.32),宠物猫(> = 1.4.2)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/lindsayrutter/bigPint
BugReports	https://github.com/lindsayrutter/bigPint/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	bigPint_1.15.0.tar.gz
Windows二进制	bigPint_1.15.0.zip
macOS二进制(x86_64)	bigPint_1.15.0.tgz
macOS二进制(arm64)	bigPint_1.15.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bigPint
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bigPint
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/bigPint/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bigPint/
包下载报告	下载数据