benchdamic

DOI:10.18129 / B9.bioc.benchdamic

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基准的微分丰富微生物组数据的方法

Bioconductor版本:发展(3.17)

从微生物数据集(16 s或WMS绝对计数的值)可以执行几个分析,评估许多微分丰度检测方法的性能。基本微分丰富和标准化版本的主要分析方法提供,但用户也可以将他的方法添加到基准。分析关注4个主要方面:1)每个方法的拟合优度分布假设观察计数数据,2)的能力控制错误发现率,3)之间的内部和方法的一致性,iv)研究结果的真实性,如果任何先验的知识。几个图形函数可用于可视化结果。

作者:Matteo Calgaro (aut (cre),奇亚拉Romualdi (aut),大卫。Risso (aut),尼古拉Vitulo (aut)

维护人员:Matteo Calgaro < mcalgaro93