这是发展版本的啤酒;稳定的发布版本,请参阅啤酒。
Bioconductor版本:发展(3.17)
啤酒实现贝叶斯模型分析phage-immunoprecipitation测序(PhIP-seq)数据。鉴于PhIPData对象,啤酒返回浓缩抗体反应的后验概率,点估计的相对叠化相比,负控制样本,以及更多。此外,啤酒提供了一个方便的实现使用磨边机识别浓缩抗体反应。
作者:陈雅典娜(aut (cre),罗布Scharpf (aut) Ingo Ruczinski (aut)
维护人员:雅典娜陈< achen70 jhu.edu >
从内部引用(R,回车引用(“啤酒”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“啤酒”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“啤酒”)
HTML | R脚本 | 啤酒 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 贝叶斯,报道,测序,软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.3.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 4.2.0),PhIPData(> = 1.1.1),rjags |
进口 | cli,刨边机,BiocParallel、方法、progressr统计数据,SummarizedExperiment,跑龙套 |
链接 | |
建议 | testthat(> = 3.0.0),BiocStyle,covr,codetools,knitr,rmarkdown,dplyr,ggplot2,拼写 |
SystemRequirements | 安装缺口(4.3.0) |
增强了 | |
URL | https://github.com/athchen/beer/ |
BugReports | https://github.com/athchen/beer/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | beer_1.3.0.tar.gz |
Windows二进制 | beer_1.3.0.zip(64位) |
macOS二进制(x86_64) | beer_1.3.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | beer_1.3.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beer |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/啤酒 |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/beer/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/beer/ |
包下载报告 | 下载数据 |