beachmat

DOI:10.18129 / B9.bioc.beachmat

这是发展beachmat版本;稳定的发布版本请参见beachmat。

编译Bioconductor来处理每种矩阵类型

生物导体版本:开发(3.14)

提供一致的c++类接口，用于向各种常用的矩阵类型读写数据。普通矩阵和几个稀疏/密集矩阵类可以直接支持，第三方S4类可以通过外部链接支持，其他所有矩阵都通过DelayedArray块处理。

作者:Aaron Lun [aut, cre]， Hervé Pagès [aut]， Mike Smith [aut]

维护者:Aaron Lun

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("beachmat")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“beachmat”)

超文本标记语言	R脚本	1.开发人员指南
超文本标记语言	R脚本	2.在c++ (v2)中读取R矩阵的数据
超文本标记语言	R脚本	3.向R矩阵对象写入数据(v2)
超文本标记语言	R脚本	4.支持任意矩阵类(v2)
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,DataRepresentation,基础设施,软件
版本	2.9.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	方法,DelayedArray(> = 0.15.14),BiocGenerics,矩阵,Rcpp
链接	Rcpp
建议	testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown,rcmdcheck,BiocParallel,HDF5Array
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
取决于我
进口我	后面;,BiocSingular,DropletUtils,mumosa,嘘,食物,天窗,单
建议我	bsseq,glmGamPoi,mbkmeans,PCAtools,scCB2
我的链接	BiocSingular,bsseq,DropletUtils,glmGamPoi,mbkmeans,PCAtools,食物,天窗,单
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	beachmat_2.9.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	beachmat_2.9.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beachmat
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ beachmat
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/beachmat/
包下载报告	下载数据