这是发展bayNorm版本;稳定版请参见bayNorm.
Bioconductor版本:开发(3.17)
bayNorm用于规范化单细胞RNA-seq数据。
作者:唐文浩[aut, cre], Franois Bertaux [aut], Philipp Thomas [aut], Claire Stefanelli [aut], Malika Saint [aut], Samuel marguerite [aut], Vahid Shahrezaei [aut]
维护者:唐文浩
引文(从R内,输入引用(“bayNorm”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("bayNorm")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“bayNorm”)
超文本标记语言 | R脚本 | bayNorm简介 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ImmunoOncology,归一化,RNASeq,测序,SingleCell,软件 |
版本 | 1.17.0 |
在Bioconductor | BioC 3.8 (R-3.5)(4年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 3.5) |
进口 | Rcpp(> = 0.12.12),BB,foreach,迭代器,doSNOW,矩阵平行,质量,locfit,fitdistrplus,统计,方法,图形,grDevices,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,BiocParallel,跑龙套 |
链接 | Rcpp,RcppArmadillo,RcppProgress |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle,devtools,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/WT215/bayNorm |
BugReports | https://github.com/WT215/bayNorm/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | bayNorm_1.17.0.tar.gz |
Windows二进制 | bayNorm_1.17.0.zip(64位) |
macOS二进制文件(x86_64) | bayNorm_1.17.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | bayNorm_1.17.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bayNorm |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bayNorm |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/bayNorm/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/bayNorm/ |
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