barcodetrackR

DOI:10.18129 / B9.bioc.barcodetrackR

这是发展barcodetrackR版本;稳定的发布版本,请参阅barcodetrackR。

分析细胞条码数据的功能

Bioconductor版本:发展(3.18)

barcodetrackR R包开发克隆跟踪数据的分析和可视化。数据所需的样品和标签丰度矩阵形式。通常从细胞条码技术实验、集成网站检索分析,或类似的技术。

作者:迭戈亚历山大•埃斯皮诺萨(aut (cre)阮兰德马忒拉克(aut)

维护人员:迭戈亚历山大·埃斯皮诺萨< diego.espinoza pennmedicine.upenn.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“barcodetrackR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“barcodetrackR”)

HTML	R脚本	barcodetrackR
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	测序,软件,可视化
版本	1.9.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(2年)
许可证	文件许可证
取决于	R (> = 4.1)
进口	cowplot、circlize dplyr、ggplot2 ggdendro, ggridges,图形,grDevices, magrittr, plyr,代理,RColorBrewer, rlang,鳞片,闪闪发亮的,统计数据,SummarizedExperiment,S4Vectors宠物猫,tidyr素食,冬青,跑龙套
链接
建议	BiocStyle,魔法knitr rmarkdown testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/dunbarlabNIH/barcodetrackR
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	barcodetrackR_1.9.0.tar.gz
Windows二进制	barcodetrackR_1.9.0.zip
macOS二进制(x86_64)	barcodetrackR_1.9.0.tgz
macOS二进制(arm64)	barcodetrackR_1.9.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/barcodetrackR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ barcodetrackR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/barcodetrackR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/barcodetrackR/
包下载报告	下载数据