舞会礼服

DOI:10.18129 / B9.bioc.ballgown

这是发展舞会礼服版本;稳定版请参见舞会礼服．

灵活的，异构体水平的差异表达分析

Bioconductor版本:开发(3.17)

组合转录组的统计分析工具，包括灵活的差异表达分析，转录本结构的可视化，以及组合转录本与注释的匹配。

作者:Jack Fu [aut]， Alyssa C. Frazee [aut, cre]， Leonardo Collado-Torres [aut]， Andrew E. Jaffe [aut]， Jeffrey T. Leek [aut, ths]

维护者:Jack Fu

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("ballgown")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“舞会礼服”)

超文本标记语言	R脚本	用Ballgown进行灵活的异构体水平差异表达分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，ImmunoOncology，预处理，RNASeq，软件，StatisticalMethod
版本	2.31.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.5.0)，方法
进口	GenomicRanges(> = 1.17.25),IRanges(> = 1.99.22),S4Vectors(> = 0.9.39),RColorBrewer样条函数,股东价值分析，limma，rtracklayer(> = 1.29.25),Biobase(> = 2.25.0),GenomeInfoDb
链接
建议	testthat，knitr，减价
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/alyssafrazee/ballgown/issues
全靠我	VaSP
进口我
建议我	聚酯，variancePartition
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ballgown_2.31.0.tar.gz
Windows二进制	ballgown_2.31.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	ballgown_2.31.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	ballgown_2.31.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ballgown
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ballgown
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ballgown/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ballgown/
软件包下载报告	下载数据