吸引

DOI:10.18129 / B9.bioc.attract

这是发展版本的吸引;稳定的发布版本,请参阅吸引。

方法找到的基因表达模块代表考夫曼司机的吸引子的风景

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包包含函数发现基因表达模块代表司机考夫曼的吸引子的风景。模块是核心吸引子通路,区分不同的细胞类型的利益团体。每个通道都有一组synexpression团体展示transcriptionally-coordinated基因表达的变化。

作者:杰西卡3月

维护人员:塞缪尔·齐默尔曼< samuel.e。齐默尔曼在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“吸引”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“吸引”)

PDF	R脚本	教程在如何使用函数\ texttt{吸引}包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,GeneSetEnrichment,ImmunoOncology,KEGG,微阵列,通路,RNASeq,Reactome,软件
版本	1.51.0
Bioconductor自	BioC 2.7 (r - 2.12)(12.5年)
许可证	LGPL (> = 2.0)
取决于	R (> = 3.4.0),AnnotationDbi
进口	Biobase,limma,集群,GOstats、图表、数据、reactome.db,KEGGREST,org.Hs.eg.db、跑龙套、方法
链接
建议	illuminaHumanv1.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	attract_1.51.0.tar.gz
Windows二进制	attract_1.51.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	attract_1.51.0.tgz
macOS二进制(arm64)	attract_1.51.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/attract
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/吸引
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/attract/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/attract/
包下载报告	下载数据