这是发展版本的apeglm;对于稳定的版本版本,请参阅apeglm.。
Bioconductor版本:开发(3.13)
APEGLM为各种GLM型号提供贝叶斯收缩估计,用于各种GLM型号,使用近似单个系数的近似。
作者:Anqi zhu [Aut,Cre],Joshua Zitovsky [CTB],Joseph Ibrahim [Aut],Michael Love [Aut]
维护者:Anqi Zhu
引文(从R内,输入引文(“APEGLM”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)#以下初始化Buoc Devel Biocmanager :: Install(版本='devel')BiocManager :: Install(“APEGLM”)的使用
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“APEGLM”)
HTML. | r script. | 使用APEGLM实现大小估计 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 贝叶斯那不同的亚兴那基因表达那免疫学那rnaseq.那测序那软件 |
版本 | 1.13.2 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.6(R-3.4)(3.5岁) |
执照 | GPL-2 |
依靠 | |
进口 | EmdBook.那概括分析那Genomicranges.,方法,统计数据,utils,rcpp. |
链接到 | rcpp.那rcppeigen.那rcppnumerical. |
建议 | deseq2.那呼吸道那kn那RAMAMAMDOW.那testthat. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | rnaseqgene. |
进口我 | 航空公司那德布雷斯勒那困惑那exoMepeak2. |
建议我 | Bambu.那Brgenomics.那deseq2.那鱼池那Nanoporernaseq. |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | apeglm_1.13.2.tar.gz. |
Windows二进制文件 | apeglm_1.13.2.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | apeglm_1.13.2.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/apeglm. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包/ apeglm |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/apeglm/ |
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