高山

DOI:10.18129 / B9.bioc.alpine

这是发展版本的高山;稳定的发布版本,请参阅高山。

高山

Bioconductor版本:发展(3.16)

片段序列偏差建模和修正RNA-seq转录丰度估计。

作者:迈克尔·爱,拉斐尔•伊

维修工:迈克尔爱< michaelisaiahlove gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“高山”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“高山”)

HTML	R脚本	高山
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing,BatchEffect,报道,DifferentialSplicing,GeneExpression,归一化,质量控制,RNASeq,测序,软件,转录,可视化
版本	1.23.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(6年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	Biostrings,IRanges,GenomicRanges,GenomicAlignments,Rsamtools,SummarizedExperiment,GenomicFeatures,speedglm样条函数,图,RBGL,stringr、数据、方法、图形GenomeInfoDb,S4Vectors
链接
建议	knitr,testthat,减价,alpineData,rtracklayer,ensembldb,BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38,RColorBrewer
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	alpine_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	alpine_1.23.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	alpine_1.23.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alpine
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/高山
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/alpine/
包下载报告	下载数据