affylmGUI

DOI:10.18129 / B9.bioc.affylmGUI

这是发展affylmGUI的版本;稳定版请参见affylmGUI

使用Affymetrix微阵列的limma包的GUI

Bioconductor版本:开发(3.17)

使用affy和limma包分析Affymetrix微阵列基因表达数据的图形用户界面(GUI)。

作者:James Wettenhall [cre,aut], Gordon Smyth [aut], Ken Simpson [aut], Keith Satterley [ctb]

维护者:Gordon Smyth < Smyth at wehi.edu.au>

引文(从R内,输入引用(“affylmGUI”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("affylmGUI")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“affylmGUI”)

超文本标记语言 about.html
PDF R脚本 affylmGUI装饰图案
超文本标记语言 CustMenu.html
PDF 从affylmGUI文件中提取affy和limma对象
超文本标记语言 index . html
超文本标记语言 windowsFocus.html
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews BatchEffect贝叶斯DataImportDifferentialExpressionGUIGeneExpression微阵列MultipleComparison归一化OneChannel预处理ProprietaryPlatforms质量控制回归软件TimeCourse转录mRNAMicroarray
版本 1.73.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 17.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于
进口 grDevices,图形,统计,utils, tcltk,tkrplotlimmaaffyaffyioaffyPLMgcrmaBiocGenericsAnnotationDbiBiocManagerR2HTMLxtable
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://bioinf.wehi.edu.au/affylmGUI/
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进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 affylmGUI_1.73.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64) affylmGUI_1.73.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) affylmGUI_1.73.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affylmGUI
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/affylmGUI
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/affylmGUI/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/affylmGUI/
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支持»

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