affycoretools

DOI:10.18129 / B9.bioc.affycoretools

这是发展affycoretools的版本;稳定版请参见affycoretools．

对使用Affymetrix基因芯片进行重复分析有用的函数

Bioconductor版本:开发(3.17)

编写了各种包装器函数，以简化核心生物统计学家可能看到的更常见的分析。

作者:詹姆斯·w·麦克唐纳

维护者:James W. MacDonald

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("affycoretools")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“affycoretools”)

超文本标记语言	R脚本	使用\Biocpkg{affycoretools}和ReportingTools创建带注释的输出
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，微阵列，OneChannel，ReportWriting，软件
版本	1.71.0
在Bioconductor	BioC 1.8 (R-2.3)(16.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase、方法
进口	affy，limma，GOstats，gcrma样条函数,xtable，AnnotationDbi，ggplot2，gplots，oligoClasses，ReportingTools，hwriter，晶格，S4Vectors，刨边机，RSQLite，BiocGenerics，DBI，Glimma
链接
建议	affydata，hgfocuscdf，BiocStyle，knitr，hgu95av2.db，rgl，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	AgiMicroRna
进口我
建议我	EnMCB
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	affycoretools_1.71.0.tar.gz
Windows二进制	affycoretools_1.71.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	affycoretools_1.71.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	affycoretools_1.71.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affycoretools
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/affycoretools
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/affycoretools/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/affycoretools/
软件包下载报告	下载数据