affycoretools

DOI:10.18129 / B9.bioc.affycoretools

这是发展affycoretools的版本;稳定版请参见affycoretools

对使用Affymetrix基因芯片进行重复分析有用的函数

Bioconductor版本:开发(3.17)

编写了各种包装器函数,以简化核心生物统计学家可能看到的更常见的分析。

作者:詹姆斯·w·麦克唐纳

维护者:James W. MacDonald

引文(从R内,输入引用(“affycoretools”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("affycoretools")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“affycoretools”)

超文本标记语言 R脚本 使用\Biocpkg{affycoretools}和ReportingTools创建带注释的输出
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression微阵列OneChannelReportWriting软件
版本 1.71.0
在Bioconductor BioC 1.8 (R-2.3)(16.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 Biobase、方法
进口 affylimmaGOstatsgcrma样条函数,xtableAnnotationDbiggplot2gplotsoligoClassesReportingToolshwriter晶格S4Vectors刨边机RSQLiteBiocGenericsDBIGlimma
链接
建议 affydatahgfocuscdfBiocStyleknitrhgu95av2.dbrglrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 AgiMicroRna
进口我
建议我 EnMCB
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 affycoretools_1.71.0.tar.gz
Windows二进制 affycoretools_1.71.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) affycoretools_1.71.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) affycoretools_1.71.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affycoretools
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/affycoretools
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/affycoretools/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/affycoretools/
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Bioconductor

R/凹口包和文档

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网