adSplit

DOI:10.18129 / B9.bioc.adSplit

这是发展adSplit版本;稳定版请参见adSplit

注解驱动的集群

Bioconductor版本:开发(3.17)

该包根据功能注释实现了微阵列基因表达谱的聚类。对于注释的每个术语基因,计算分成两个子类,并确定支持基因集的显著性。

作者:Claudio Lottaz, Joern Toedling

维护者:Claudio Lottaz

引文(从R内,输入引用(“adSplit”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("adSplit")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“adSplit”)

PDF R脚本 注解驱动的集群
PDF 参考手册

细节

biocViews 聚类微阵列软件
版本 1.69.0
在Bioconductor BioC 1.8 (R-2.3)(16.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 2.1.0),方法(>= 2.1.0)
进口 AnnotationDbiBiobase(> = 1.5.12),集群(> = 1.9.1),GO.db(>= 1.8.1),图形,grDevices,KEGGREST(> = 1.30.1),(>= 1.6.0), stats (>= 2.1.0)
链接
建议 golubEsets(> = 1.0),vsn(> = 1.5.0),hu6800.db(> = 1.8.1)
SystemRequirements
增强了
URL http://compdiag.molgen.mpg.de/software/adSplit.shtml
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 adSplit_1.69.0.tar.gz
Windows二进制 adSplit_1.69.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) adSplit_1.69.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) adSplit_1.69.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/adSplit
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/adSplit
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/adSplit/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/adSplit/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网