adSplit

DOI:10.18129 / B9.bioc.adSplit

这是发展adSplit版本;稳定版请参见adSplit．

注解驱动的集群

Bioconductor版本:开发(3.17)

该包根据功能注释实现了微阵列基因表达谱的聚类。对于注释的每个术语基因，计算分成两个子类，并确定支持基因集的显著性。

作者:Claudio Lottaz, Joern Toedling

维护者:Claudio Lottaz

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("adSplit")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“adSplit”)

PDF	R脚本	注解驱动的集群
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类，微阵列，软件
版本	1.69.0
在Bioconductor	BioC 1.8 (R-2.3)(16.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R(>= 2.1.0)，方法(>= 2.1.0)
进口	AnnotationDbi，Biobase(> = 1.5.12),集群(> = 1.9.1),GO.db(>= 1.8.1)，图形，grDevices，KEGGREST(> = 1.30.1),乘(>= 1.6.0)， stats (>= 2.1.0)
链接
建议	golubEsets(> = 1.0),vsn(> = 1.5.0),hu6800.db(> = 1.8.1)
SystemRequirements
增强了
URL	http://compdiag.molgen.mpg.de/software/adSplit.shtml
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	adSplit_1.69.0.tar.gz
Windows二进制	adSplit_1.69.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	adSplit_1.69.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	adSplit_1.69.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/adSplit
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/adSplit
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/adSplit/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/adSplit/
软件包下载报告	下载数据