- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- aCGH(开发版)
aCGH
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DOI:10.18129 / B9.bioc.aCGH
这是发展aCGH版本;稳定的发布版本,请参阅aCGH。
阵列比较基因组杂交数据的类和函数
Bioconductor版本:发展(3.17)
从图像分析功能阅读aCGH数据输出文件和克隆信息文件,创建aCGH S3对象来存储这些数据。基本方法来访问/替换,构造子集、印刷和策划aCGH对象。
作者:简Fridlyand < jfridlyand cc.ucsf.edu >,彼得季米特洛夫季米特洛夫< stat.Berkeley.EDU >
季米特洛夫维护者:彼得季米特洛夫< stat.Berkeley.EDU >
从内部引用(R,回车引用(“aCGH”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“aCGH”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“aCGH”)
| R脚本 | aCGH概述 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | CopyNumberVariation,DataImport,遗传学,软件 |
| 版本 | 1.77.0 |
| Bioconductor自 | BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 2.10),集群,生存,乘 |
| 进口 | BiobasegrDevices图形,方法、统计数据、样条函数,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | CRImage |
| 进口我 | ADaCGH2,rCGH,snapCGH |
| 建议我 | beadarraySNP |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | aCGH_1.77.0.tar.gz |
| Windows二进制 | aCGH_1.77.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | aCGH_1.77.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/aCGH |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ aCGH |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/aCGH/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
