变体工具
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doi：10.18129/b9.bioc.varianttools
这是发展VariantTools的版本；对于稳定版本，请参阅变体工具。
用于探索性呼叫的探索性分析工具
生物导体版本：开发（3.14）
使用过滤器探索，诊断和比较变体调用。
作者：迈克尔·劳伦斯（Michael Lawrence）
维护者：迈克尔·劳伦斯（Michael Lawrence）
引用（从r内，输入引用（“ varianttools”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）＃以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: Install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ varianttools”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ varianttools”）
| R脚本 | Varianttools简介 | |
| tutorial.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 遗传因素，，，，遗传学，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.35.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.11（R-2.15）（8。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | S4VECTORS（> = 0.17.33），iranges（> = 2.13.12），基因组机（> = 1.31.8），变体（> = 1.11.16），方法 |
| 进口 | rsamtools（> = 1.31.2），生物基因，，，，生物弦， 平行，GenomicFeatures（> = 1.31.3），矩阵，，，，rtracklayer（> = 1.39.7），生物比较，，，，GenomeInfodB，，，，BSGENOME，，，，生物酶 |
| 链接 | |
| 建议 | 运行，，，，肺部（> = 0.0.6），rbgl，，，，图形，，，，GMAPR（> = 1.21.3） |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | htseqgenie，，，，mmappr2 |
| 建议我 | VariantToolsData |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | varianttools_1.35.0.tar.gz |
| Windows二进制 | varianttools_1.35.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | varianttools_1.35.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/varianttools |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/varianttools |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/varianttools/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
