varcon
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doi：10.18129/b9.bioc.varcon
这是发展VARCON的版本；对于稳定版本，请参阅varcon。
VARCON：用于检索SNV相邻核苷酸的R包装
生物导体版本：开发（3.16）
VARCON是一个R软件包，它从单个核苷酸变化（SNV）的注释（指编码序列或参考基因组序列）中转换位置信息。它检索了单核苷酸变异位置周围的基因组参考序列。对于驴子，SNV是否可以潜在地影响剪接调节蛋白的结合，即作为估计，将六倍分型分数计算。此外，VARCON还报告了检索到的基因组序列中剪接位点的剪接位点强度以及SNV引起的任何变化。
作者：Johannes Ptok [AUT，CRE]
维护者：Johannes Ptok
引用（从r内，输入引用（“ varcon”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ varcon”）的用法
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ varcon”）
| html | R脚本 | 用VARCON分析SNV |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 替代方案，，，，功能基因组学，，，，软件 |
| 版本 | 1.5.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.13（R-4.1）（1年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | 生物弦，，，，BSGENOME，，，，基因组机，r（> = 4.1） |
| 进口 | 方法，统计，iranges，，，，闪亮的，，，，Shinycsssloaders，，，，光泽，，，，GGPLOT2 |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | varcon_1.5.0.tar.gz |
| Windows二进制 | varcon_1.5.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | varcon_1.5.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/varcon |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/varcon |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/varcon/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
