VaSP

DOI:10.18129 / B9.bioc.VaSP

这是发展VaSP版本;稳定的发布版本,请参阅VaSP。

量化和可视化的拼接在人口的变化

Bioconductor版本:发展(3.17)

发现全基因组变量从短内容可变剪接事件RNA-seq数据和基因剪接的可视化信息可发布多层面板数据在人群中。(警告:可视化函数删除由于依赖包寿司弃用。如果你想使用它,请换回旧版本)。

作者:慧慧Yu (aut (cre),钱Du (aut)张,气(aut)

维修工:慧慧于< yuhuihui2011 foxmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(VaSP)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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细节

biocViews	AlternativeSplicing,聚类,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,ImmunoOncology,KEGG,预处理,RNASeq,软件,StatisticalMethod,可视化
版本	1.11.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2年)
许可证	GPL (> = 2.0)
取决于	R (> = 4.0),舞会礼服
进口	IRanges,GenomicRanges,S4Vectors平行,matrixStats,GenomicAlignments,GenomeInfoDb,Rsamtools,集群、统计数据、图形、方法
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/yuhuihui2011/VaSP
BugReports	https://github.com/yuhuihui2011/VaSP/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	VaSP_1.11.0.tar.gz
Windows二进制	VaSP_1.11.0.zip
macOS二进制(x86_64)	VaSP_1.11.0.tgz
macOS二进制(arm64)	VaSP_1.11.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/VaSP
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ VaSP
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/VaSP/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/VaSP/
包下载报告	下载数据