Ularcirc

doi：10.18129/b9.bioc.ullcirc

这是发展ularcirc的版本；对于稳定版本，请参阅Ularcirc。

用于规范和背部剪接分析的闪亮应用程序（即圆形和mRNA分析）

生物导体版本：开发（3.16）

ULARCIRC在星形对齐的剪接连接文件中读取，并提供可视化和分析工具用于剪接分析。用户可以评估后置路口和前进典型连接。

作者：David Humphreys [AUT，CRE]

维护者：David Humphreys

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ ularcirc”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ ularcirc”）

html	R脚本	Ularcirc
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	替代方案，，，，注解，，，，覆盖范围，，，，datarepresentation，，，，差速器，，，，遗传学，，，，测序，，，，软件，，，，可视化
版本	1.15.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁）
执照	文件执照
要看	R（> = 3.4.0）
进口	AnnotationHub，，，，AnnotationDbi，，，，生物基因，，，，生物弦，，，，BSGENOME，，，，Data.Table（> = 1.9.4），DT，，，，GenomicFeatures，，，，GenomeInfodB，，，，GenomeInfodBdata，，，，基因组签名，，，，基因组机，，，，GGPLOT2，，，，Ggrepel，，，，gsubfn，，，，mirbase.db，，，，时刻，，，，有机体，，，，Plotgardener，，，，r.utils，，，，S4VECTORS，，，，闪亮的，，，，发光的dashboard，，，，光泽，，，，Shinyjs，，，，Yaml
链接
建议	bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38，，，，生物使用，，，，httpuv，，，，尼特，，，，org.hs.eg.db，，，，rmarkDown，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ularcirc_1.15.0.tar.gz
Windows二进制	ularcirc_1.15.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	ularcirc_1.15.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ularcirc
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/ularcirc
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/ularcirc/
软件包下载报告	下载统计