Ucell
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doi：10.18129/b9.bioc.ucell
这是发展Ucell的版本；对于稳定版本，请参阅Ucell。
基于等级的签名丰富分析单细胞数据
生物导体版本：开发（3.16）
UCELL是用于评估单细胞数据集中基因特征的软件包。基于Mann-Whitney U统计量的UCELL签名分数对数据集大小和异质性非常健壮，并且它们的计算比其他可用方法所需的计算时间和内存更少，因此即使在有限的机器上，可以在几分钟内处理大型数据集，甚至可以在有限的机器上处理大型数据集计算能力。UCELL可以应用于任何单细胞数据矩阵，并包含直接与SingleCellexperiment和Seurat对象交互的功能。
作者：Massimo Andreatta [AUT，CRE]
，圣地亚哥Carmona [aut]
维护者：Massimo andreatta
引用（从r内，输入引用（“ Ucell”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ ucell”）的用法
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Ucell”）
| html | R脚本 | 1.用Ucell进行基因签名评分 |
| html | R脚本 | 2.将UCELL与单链球运动一起使用 |
| html | R脚本 | 3.将Ucell与Seurat一起使用 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 蜂窝基，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录组学 |
| 版本 | 2.1.2 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.15（R-4.2）（<6个月） |
| 执照 | GPL-3 +文件执照 |
| 要看 | R（> = 4.2.0） |
| 进口 | 方法，Data.Table（> = 1.13.6），矩阵，，，，生物比较，，，，生物脑，，，，Singlecellexperiment，，，，总结性特征 |
| 链接 | |
| 建议 | Seurat，，，，评分，，，，scrnaseq，，，，RESHAPE2，，，，拼布，，，，GGPLOT2，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/carmonalab/ucell |
| BugReports | https://github.com/carmonalab/ucell/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 逃脱 |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | ucell_2.1.2.2.tar.gz |
| Windows二进制 | ucell_2.1.2.2.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | ucell_2.1.2.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ucell |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/ucell |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ucell/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
