TurboNorm

DOI:10.18129 / B9.bioc.TurboNorm

这是发展TurboNorm版本;稳定版请参见TurboNorm

适用于微阵列归一化的快速散点图平滑器

Bioconductor版本:开发(3.16)

一种基于二阶差分惩罚b样条的快速散点平滑算法。单色数据的微阵列归一化函数,如Affymetrix/Illumina和作为marray marrayraw对象或limma rglist对象提供的双色数据。

作者:Maarten van Iterson和Chantal van Leeuwen

维护者:Maarten van Iterson

引文(从R内,输入引用(“TurboNorm”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("TurboNorm")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“TurboNorm”)

PDF R脚本 TurboNorm概述
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CpGIslandDNAMethylationMethylationArray微阵列归一化OneChannel预处理软件TwoChannel
版本 1.45.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(11年)
许可证 LGPL
取决于 R (>= 2.12.0),转换limma(> = 1.7.0),marray
进口 grDevices统计数据,affy晶格
链接
建议 BiocStyleaffydata
SystemRequirements
增强了
URL http://www.humgen.nl/MicroarrayAnalysisGroup.html
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 TurboNorm_1.45.0.tar.gz
Windows二进制 TurboNorm_1.45.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) TurboNorm_1.45.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TurboNorm
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TurboNorm
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TurboNorm/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网