这是发展TreeAndLeaf版本;稳定版请参见TreeAndLeaf.
Bioconductor版本:开发(3.17)
TreeAndLeaf包结合了无根和力向图算法来布局二叉树,旨在将多层信息表示到树状图叶子上。
作者:Leonardo W. Kume, Luis E. A. Rizzardi, Milena A. Cardoso, Mauro A. A. Castro
维护者:Milena A. Cardoso
引文(从R内,输入引用(“TreeAndLeaf”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("TreeAndLeaf")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“TreeAndLeaf”)
超文本标记语言 | R脚本 | TreeAndLeaf:树状图的图形布局。 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataRepresentation,GraphAndNetwork,基础设施,网络,软件,可视化 |
版本 | 1.11.0 |
在Bioconductor | BioC 3.11 (R-4.0)(3年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 4.0) |
进口 | 红色的(> = 1.40.4),igraph,猿 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle,RUnit,BiocGenerics,stringr,geneplast,ggtree,ggplot2,dplyr,dendextend,RColorBrewer |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | 红色的 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | TreeAndLeaf_1.11.0.tar.gz |
Windows二进制 | TreeAndLeaf_1.11.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | TreeAndLeaf_1.11.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | TreeAndLeaf_1.11.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TreeAndLeaf |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TreeAndLeaf |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/TreeAndLeaf/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TreeAndLeaf/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |