- 家
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- TransView(开发版)
TransView
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.TransView
这是发展TransView版本;稳定的发布版本,请参阅TransView。
读密度地图建设和加入。ChIPSeq和RNASeq数据集的可视化
Bioconductor版本:发展(3.16)
这个包提供了有效的工具来生成,访问和显示读取基于密度的测序数据集从RNA-Seq和ChIP-Seq等。
作者:尤利乌斯•穆勒
维修工:朱利叶斯·穆勒在alumni.ethz.ch > < ju-mu
从内部引用(R,回车引用(“TransView”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“TransView”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“TransView”)
| R脚本 | 介绍TransView | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ChIPSeq,聚类,DNAMethylation,DataImport,GeneExpression,ImmunoOncology,MethylSeq,微阵列,MultipleComparison,RNASeq,测序,软件,转录,可视化 |
| 版本 | 1.41.1 |
| Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(10年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | 方法,GenomicRanges |
| 进口 | BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges,zlibbioc,gplots |
| 链接 | Rhtslib(> = 1.99.1) |
| 建议 | RUnit,pasillaBamSubset,BiocManager |
| SystemRequirements | GNU使 |
| 增强了 | |
| URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/html/TransView.html |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | TransView_1.41.1.tar.gz |
| Windows二进制 | TransView_1.41.1.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | TransView_1.41.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TransView |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TransView |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TransView/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
