轨迹

doi:10.18129/b9

这是发展轨迹的版本;对于稳定版本,请参阅轨迹

单细胞轨迹分析实用程序

生物导体版本:开发(3.16)

实施低级实用程序用于单细胞轨迹分析,主要用于在高级软件包内重复使用。包括一个函数来创建群集级的最小跨越树和数据结构,以保留假频率推理结果。

作者:凯利街[aut]亚伦·伦[AUT,CRE]

维护者:aaron lun

引用(从r内,输入引用(“轨迹”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ traightoryutils”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“轨迹”)

html R脚本 轨迹公用事业
PDF 参考手册

细节

生物浏览 基因表达,,,,Singlecell,,,,软件
版本 1.5.0
在生物导体中 Bioc 3.13(R-4.1)(1年)
执照 GPL-3
要看 Singlecellexperiment
进口 方法,统计,矩阵,,,,Igraph,,,,S4VECTORS,,,,总结性特征
链接
建议 生物脑,,,,延迟,,,,延迟的matrixstats,,,,生物比较,,,,测试,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL //www.anjoumacpherson.com/packages/traightoryutils
BugReports https://github.com/ltla/traightoryutils/issues
取决于我 弹弓,,,,TSCAN
进口我 调味品,,,,Singlecelltk,,,,Tradeseq
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 轨迹_1.5.0.tar.gz
Windows二进制 轨迹_1.5.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) 轨迹_1.5.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/traightoryutils
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/轨迹
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/traightoryutils/
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