ToxicoGx

DOI:10.18129 / B9.bioc.ToxicoGx

这是发展ToxicoGx版本;稳定的发布版本请参见ToxicoGx。

大规模毒物基因组数据分析

生物导体版本:开发(3.14)

包含一组用于对毒物基因组数据进行大规模分析的函数，提供一个标准化的数据结构来保存与毒物基因组数据的注释、可视化和统计分析相关的信息。

作者:Sisira Nair, Esther Yoo [aut]， Christopher Eeles [aut]， Amy Tang [aut]， Nehme El-Hachem [aut]， Petr Smirnov [aut]， Benjamin Haibe-Kains [aut, cre]

维护人员:Benjamin Haibe-Kains < Benjamin .haibe。实物地租在utoronto.ca >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("ToxicoGx")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ToxicoGx”)

超文本标记语言	R脚本	ToxicoGx:一个综合毒物基因组学数据分析的R平台
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GeneExpression,遗传药理学,药物基因组学,软件
版本	1.3.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.1),CoreGx
进口	SummarizedExperiment,S4Vectors,Biobase,BiocParallel,ggplot2,宠物猫,dplyr,caTools,下载器,magrittr、方法、reshape2,tidyr,data.table,为了,尺度、graphics、grDevices、parallel、stats、utils、limma,jsonlite
链接
建议	rmarkdown,testthat,BiocStyle,knitr,tinytex,devtools,PharmacoGx,xtable,减价
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ToxicoGx_1.3.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	ToxicoGx_1.3.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ToxicoGx
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ToxicoGx
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ToxicoGx/
包下载报告	下载数据