这是发展TileDBArray版本;稳定版请参见TileDBArray.
Bioconductor版本:开发(3.17)
实现一个DelayedArray后端,用于读写TileDB格式的密集或稀疏数组。生成的tiledbarray与所有可以接受DelayedArray实例的Bioconductor管道兼容。
作者:Aaron Lun [aut, cre],基因泰克公司[cph]
维护者:Aaron Lun
引文(从R内,输入引用(“TileDBArray”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("TileDBArray")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“TileDBArray”)
超文本标记语言 | R脚本 | 用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | DataRepresentation,基础设施,软件 |
版本 | 1.9.0 |
在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | DelayedArray(> = 0.15.16) |
进口 | 方法,Rcpp,tiledb,S4Vectors |
链接 | Rcpp |
建议 | knitr,矩阵,rmarkdown,BiocStyle,BiocParallel,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/LTLA/TileDBArray |
BugReports | https://github.com/LTLA/TileDBArray |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | TileDBArray_1.9.0.tar.gz |
Windows二进制 | TileDBArray_1.9.0.zip(64位) |
macOS二进制文件(x86_64) | TileDBArray_1.9.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | TileDBArray_1.9.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TileDBArray |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TileDBArray |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/TileDBArray/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TileDBArray/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |