TargetSearch

DOI:10.18129 / B9.bioc.TargetSearch

这是发展TargetSearch版本;稳定的发布版本,请参阅TargetSearch。

一个包的gc - ms代谢物分析数据的分析

Bioconductor版本:发展(3.18)

这个包提供了一种灵活的、快速和准确的目标- ms数据预处理的方法。用户提供了一组(通常是非常大的)的GC色谱和代谢物图书馆的目标。包会自动搜索这些目标色谱导致一个数据矩阵,可用于进一步的数据分析。

作者:Alvaro Cuadros-Inostroza (aut (cre), Jan Lisec (aut)亨宁Redestig (aut),马特·汉纳(aut)

维护人员:Alvaro Cuadros-Inostroza < acuadros + bioc gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“TargetSearch”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“TargetSearch”)

PDF	R脚本	国际扶轮校正额外
PDF	R脚本	TargetSearch包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DecisionTree,ImmunoOncology,MassSpectrometry,预处理,软件
版本	2.3.1
Bioconductor自	BioC 2.4 (r - 2.9)(14年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于
进口	图形、grDevices方法、ncdf4统计,跑龙套,为了
链接
建议	TargetSearchData,BiocStyle、knitr tinytest
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/acinostroza/TargetSearch
BugReports	https://github.com/acinostroza/TargetSearch/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	TargetSearch_2.3.1.tar.gz
Windows二进制	TargetSearch_2.3.1.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	TargetSearch_2.3.1.tgz
macOS二进制(arm64)	TargetSearch_2.3.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TargetSearch
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TargetSearch
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/TargetSearch/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TargetSearch/
包下载报告	下载数据