TPP2D

DOI:10.18129 / B9.bioc.TPP2D

这是发展TPP2D版本;稳定版请参见TPP2D．

利用二维热谱(DLPTP)检测配体-蛋白质相互作用

Bioconductor版本:开发(3.14)

从2D热剖面(DLPTP)检测配体-蛋白质相互作用，通过跨温度剂量响应曲线的功能分析，对2D- tpp实验进行fdr控制分析。

作者:Nils Kurzawa [aut, cre]， Holger Franken [aut]， Simon Anders [aut]， Wolfgang Huber [aut]， Mikhail M. Savitski [aut]

维护者:Nils Kurzawa < Nils。Kurzawa在embl.de>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("TPP2D")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“TPP2D”)

超文本标记语言	R脚本	2D-TPP分析的TPP2D介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，蛋白质组学，软件
版本	1.9.1
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.6.0)， stats, utils，dplyr、方法
进口	ggplot2，tidyr，foreach，doParallel，openxlsx，stringr，RCurl平行,质量，BiocParallel，limma
链接
建议	knitr，testthat，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/TPP2D
BugReports	https://support.bioconductor.org/
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	TPP2D_1.9.1.tar.gz
Windows二进制	TPP2D_1.9.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	TPP2D_1.9.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TPP2D
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TPP2D
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TPP2D/
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