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- Bioconductor 3.18
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- TNBC.CMS(development version)
TNBC.CMS
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DOI:10.18129 / B9.bioc.TNBC.CMS
这是发展TNBC.CMS版本;稳定的发布版本,请参阅TNBC.CMS。
TNBC.CMS: Prediction of TNBC Consensus Molecular Subtypes
Bioconductor版本:发展(3.18)
这个方案实现了一个基于机器学习分类器分配的共识分子亚型TNBC样本。它还提供了功能总结基因组和临床特点。
作者:Doyeong Yu,金,她在公园,Charny公园
维护人员:Doyeong Yu < parklab。bi: gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“TNBC.CMS”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“TNBC.CMS”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“TNBC.CMS”)
| R脚本 | TNBC.CMS.pdf | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 分类,聚类,GeneExpression,GenePrediction,软件,SupportVectorMachine |
| 版本 | 1.17.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.9 (r - 3.6)(4年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.6.0)、e1071 quadprog,SummarizedExperiment |
| 进口 | GSVA(> = 1.26.0)pheatmap、grDevices RColorBrewer, pracma GGally, R。跑龙套,forestplot ggplot2 ggpubr,生存、网格、属性、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | TNBC.CMS_1.17.0.tar.gz |
| Windows二进制 | TNBC.CMS_1.17.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | TNBC.CMS_1.17.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TNBC.CMS |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TNBC.CMS |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/TNBC.CMS/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TNBC.CMS/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
