SynExtend

DOI:10.18129 / B9.bioc.SynExtend

这是发展SynExtend版本;稳定的发布版本,请参阅SynExtend

处理同线性对象的工具

Bioconductor版本:发展(3.17)

基因组序列之间共享秩序提供了大量的信息。同线性对象由R包解密提供定量信息,共享秩序。从同线性对象SynExtend提供工具来提取信息。

作者:尼古拉斯·厄尔(aut (cre),艾丹Lakshman aut,施Adelle费尔南多(施),埃里克·赖特(aut)

维修工:尼古拉斯·厄尔在pitt.edu < npc19 >

从内部引用(R,回车引用(“SynExtend”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SynExtend”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SynExtend”)

PDF R脚本 UsingSynExtend
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类,ComparativeGenomics,DataImport,遗传学,软件
版本 1.11.4
Bioconductor自 BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 4.2.0),解读(> = 2.24.0)
进口 方法,Biostrings,S4Vectors,IRanges跑龙套,统计、并行、图形grDevices
链接
建议 BiocStyle,knitr,igraph,减价,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 SynExtend_1.11.4.tar.gz
Windows二进制 SynExtend_1.11.4.zip
macOS二进制(x86_64) SynExtend_1.11.4.tgz
macOS二进制(arm64) SynExtend_1.11.4.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SynExtend
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SynExtend
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SynExtend/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SynExtend/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网