- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- SynExtend(开发版)
SynExtend
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SynExtend
这是发展SynExtend版本;稳定的发布版本,请参阅SynExtend。
处理同线性对象的工具
Bioconductor版本:发展(3.17)
基因组序列之间共享秩序提供了大量的信息。同线性对象由R包解密提供定量信息,共享秩序。从同线性对象SynExtend提供工具来提取信息。
作者:尼古拉斯·厄尔(aut (cre)
,艾丹Lakshman aut,施Adelle费尔南多(施),埃里克·赖特(aut)
维修工:尼古拉斯·厄尔在pitt.edu < npc19 >
从内部引用(R,回车引用(“SynExtend”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SynExtend”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SynExtend”)
| R脚本 | UsingSynExtend | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 聚类,ComparativeGenomics,DataImport,遗传学,软件 |
| 版本 | 1.11.4 |
| Bioconductor自 | BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 4.2.0),解读(> = 2.24.0) |
| 进口 | 方法,Biostrings,S4Vectors,IRanges跑龙套,统计、并行、图形grDevices |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,igraph,减价,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SynExtend_1.11.4.tar.gz |
| Windows二进制 | SynExtend_1.11.4.zip |
| macOS二进制(x86_64) | SynExtend_1.11.4.tgz |
| macOS二进制(arm64) | SynExtend_1.11.4.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SynExtend |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SynExtend |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SynExtend/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SynExtend/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
