结构线
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doi：10.18129/b9.bioc.structstrings
这是发展结构弦的版本；对于稳定版本，请参阅结构线。
使用生物弦的DOT支架注释的实施
生物导体版本：开发（3.16）
结构包装实现了广泛使用的点支架注释，用于将基本配对信息存储在结构化RNA中。structStrings使用BioStrings软件包提供的基础架构，并从BSTRING类中得出DotbracketString和相关类。从这些过程中，可以在深度分析中产生基对表。另外，也可以检索基础对的循环指数。为了提高效率，在C中实现了信息转换，并受到Viennarna软件包的启发。
作者：Felix G.M.恩斯特[aut，cre]
维护者：Felix G.M.ernst
引用（从r内，输入引用（“结构线”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ structStrings”）的用法
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“结构线”）
| html | R脚本 | 结构线 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 结盟，，，，DataImport，，，，datarepresentation，，，，基础设施，，，，测序，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.13.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.9（R-3.6）（3.5岁） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 4.0），S4VECTORS（> = 0.27.12），iranges（> = 2.23.9），生物弦（> = 2.57.2） |
| 进口 | 方法，生物基因，，，，xvector，，，，Stringr，，，，Stringi，，，，蜡笔，grdevices |
| 链接 | iranges，，，，S4VECTORS |
| 建议 | 测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，Trnascanimport，，，，生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/felixernst/structstrings |
| BugReports | https://github.com/felixernst/structstrings/issues |
| 取决于我 | tRNA，，，，Trnadbimport |
| 进口我 | Trnascanimport |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | structStrings_1.13.0.tar.gz |
| Windows二进制 | structStrings_1.13.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | structStrings_1.13.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/structstrings |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/结构线 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/Structstrings/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
