拖缆

DOI:10.18129 / B9.bioc.Streamer

这是发展版本的拖缆;稳定的发布版本,请参阅拖缆。

使流处理大型文件

Bioconductor版本:发展(3.16)

大型数据文件可以在R难以处理,数据通常驻留在内存中。这个包鼓励一个编程风格,数据从磁盘“流”到R通过“生产者”,通过一系列的“消费者”,通常减少原始数据在可控的范围内。包提供了有用的生产国和消费国流组件数据输入等操作,采样、索引、和转换;看到包吗?拖缆for details.

作者:作者Nishant Gopalakrishnan马丁•摩根

维修工:马丁·摩根<马丁。摩根在roswellpark.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“流光”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“流光”)

PDF	R脚本	横幅:一个简单的例子
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport,基础设施,软件
版本	1.43.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(10.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	方法,图,RBGL平行,BiocGenerics
链接
建议	RUnit,Rsamtools(> = 1.5.53),GenomicAlignments,Rgraphviz
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	plethy
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Streamer_1.43.0.tar.gz
Windows二进制	Streamer_1.43.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	Streamer_1.43.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Streamer
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/拖缆
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Streamer/
包下载报告	下载数据