这是发展《星际迷航》版本;稳定版请参见StarBioTrek.
Bioconductor版本:开发(3.17)
该工具StarBioTrek提供了一些方法来测量通路活动和通路之间的串扰,同时还集成了网络数据的信息。
作者:Claudia Cava, Isabella Castiglioni
维护者:Claudia Cava < Claudia。卡瓦在ibfm.cnr.it>
引文(从R内,输入引用(“StarBioTrek”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("StarBioTrek")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“StarBioTrek”)
超文本标记语言 | R脚本 | 装饰图案的标题 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneRegulation,KEGG,网络,通路,软件 |
版本 | 1.25.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(6.5年) |
许可证 | GPL (>= 3) |
取决于 | R (>= 3.3) |
进口 | SpidermiR,石墨,AnnotationDbi,e1071,ROCR,MLmetricsgrDevices,igraph,reshape2,ggplot2 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,devtools,roxygen2,qgraph,png、网格 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/claudiacava/StarBioTrek |
BugReports | https://github.com/claudiacava/StarBioTrek/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | StarBioTrek_1.25.0.tar.gz |
Windows二进制 | StarBioTrek_1.25.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | StarBioTrek_1.25.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | StarBioTrek_1.25.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/StarBioTrek |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/StarBioTrek |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/StarBioTrek/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/StarBioTrek/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |