- 家
- Bioconductor 3.18
- 软件包
- SpeCond(开发版)
SpeCond
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.SpeCond
这是发展SpeCond版本;稳定的发布版本,请参阅SpeCond。
条件表达式的具体检测数据
Bioconductor版本:发展(3.18)
这个包执行基因表达数据分析来检测condition-specific基因。这样明显上升或下调基因在一个小数量的条件。它是通过拟合的混合正态分布表达式的值。条件可以是环境条件,不同组织、器官或任何其他来源,你想比较基因表达。
作者:佛罗伦萨卡瓦利
维护人员:佛罗伦萨卡瓦利<佛罗伦萨在ebi.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“SpeCond”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SpeCond”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SpeCond”)
| R脚本 | SpeCond | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 聚类,DifferentialExpression,微阵列,MultipleComparison,ReportWriting,软件 |
| 版本 | 1.55.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.5 (r - 2.10)(13.5年) |
| 许可证 | LGPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 2.10.0), mclust (> = 3.3.1),Biobase(> = 1.15.13)、字段hwriter (> = 1.1), RColorBrewer、方法 |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SpeCond_1.55.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SpeCond_1.55.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | SpeCond_1.55.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | SpeCond_1.55.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SpeCond |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SpeCond |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/SpeCond/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SpeCond/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
